由于熱保護(hù)器配件有些增強(qiáng)子位于啟動子上游，有些位于下游，所以熱保護(hù)器配件的效應(yīng)并不取決于熱保護(hù)器配件同啟動子的相對位置。因此，對熱保護(hù)器配件效應(yīng)的方向性的原因還沒有真正弄清楚。目前已發(fā)現(xiàn)有兩個(gè)基因座以反式活化方式影響熱保護(hù)器配件的功能。基因S2J(Hw)編碼的核蛋白識別熱保護(hù)器配件，熱保護(hù)器配件同其結(jié)合后才有絕緣作用。當(dāng)該基因突變后，盡管y基因座中插入了熱保護(hù)器配件，但失去了絕緣作用，y在所有組織中都表達(dá)。
另一個(gè)基因座是mod(mdg 4)，該基因發(fā)生突變后，其效應(yīng)正好與Su(Hw)相反，即這些突變型都增強(qiáng)了絕緣作用，使熱保護(hù)器配件的絕緣效應(yīng)不再有方向性而得到擴(kuò)展，也就是阻斷了上游和下游兩側(cè)的增強(qiáng)子的效應(yīng)。有一種解釋認(rèn)為先是Su(Hw)同熱保護(hù)器配件DNA結(jié)合后，使熱保護(hù)器配件有絕緣效應(yīng)。mod(mdg4)同Su(Hw)結(jié)合，使熱保護(hù)器配件失去絕緣效應(yīng)；突變的mod(mdg4)不能同Su(Hw)結(jié)合，于是熱保護(hù)器配件又增強(qiáng)了絕緣作用。
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